Она родилась 23 февраля 1964 года. Отец, Билл Скалли, служил на флоте, и семья, следуя за ним, постоянно перебиралась с одной военной базы на другую. Дана была бойкой девочкой - стреляла из ружья, интересовалась моделями самолетов. В 13 лет тайком курила. В 1986 году она получила степень бакалавра по физике в университете Мериленда. Затем Скалли поступила в медицинскую школу, где ее еще во время учебы завербовали в ФБР. Отказавшись от врачебной практики и поступая против воли родителей, она поступила в Академию ФБР. Успешно закончив курс обучения, еще два года она уже сама преподавала в Квантико судебную медицину. Она на хорошем счету у начальства, ее карьера продвигалась вполне успешно, но затем ее назначили в напарники к агенту Малдеру в отдел «Секретных Материалов», 6 марта 1992 года.

Скалли частенько закрывает глаза на очевидные факты, только потому, что считает, что всему должно быть рациональное объяснение. Официальным заданием для Скалли было писать отчеты про «С.М» и Малдера. Но по ходу работы они очень сблизились, и, конечно, ни о каких отчетах не могло и быть речи.